MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013205	GAG	2	6	55990	55995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510063
1002	NC_013205	GC	3	6	56002	56007	0 %	0 %	50 %	50 %	258510063
1003	NC_013205	GC	3	6	56048	56053	0 %	0 %	50 %	50 %	258510063
1004	NC_013205	CCG	2	6	56125	56130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510063
1005	NC_013205	CGG	2	6	56165	56170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510063
1006	NC_013205	GAGC	2	8	56352	56359	25 %	0 %	50 %	25 %	258510064
1007	NC_013205	GAC	3	9	56376	56384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510064
1008	NC_013205	TCA	2	6	56396	56401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510064
1009	NC_013205	CTC	2	6	56433	56438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510064
1010	NC_013205	GTG	2	6	56484	56489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510064
1011	NC_013205	GGC	2	6	56515	56520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510064
1012	NC_013205	TGA	2	6	56539	56544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510064
1013	NC_013205	CGG	2	6	56549	56554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510064
1014	NC_013205	GTG	2	6	56562	56567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510064
1015	NC_013205	TCG	2	6	56578	56583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510064
1016	NC_013205	GAT	2	6	56616	56621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510064
1017	NC_013205	TGC	2	6	56737	56742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510064
1018	NC_013205	CGC	2	6	56827	56832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510064
1019	NC_013205	CGGA	2	8	56869	56876	25 %	0 %	50 %	25 %	258510064
1020	NC_013205	GCG	2	6	56891	56896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510064
1021	NC_013205	CAT	2	6	56909	56914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510064
1022	NC_013205	GAGC	2	8	56924	56931	25 %	0 %	50 %	25 %	258510064
1023	NC_013205	CTCG	2	8	56969	56976	0 %	25 %	25 %	50 %	258510064
1024	NC_013205	TGACGC	2	12	56995	57006	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258510064
1025	NC_013205	TGCG	2	8	57044	57051	0 %	25 %	50 %	25 %	258510064
1026	NC_013205	CGA	2	6	57116	57121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510064
1027	NC_013205	CCT	2	6	57125	57130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510064
1028	NC_013205	GGC	2	6	57183	57188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510064
1029	NC_013205	GAAG	2	8	57209	57216	50 %	0 %	50 %	0 %	258510064
1030	NC_013205	TCCG	2	8	57259	57266	0 %	25 %	25 %	50 %	258510064
1031	NC_013205	CTT	2	6	57293	57298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510064
1032	NC_013205	CG	3	6	57313	57318	0 %	0 %	50 %	50 %	258510064
1033	NC_013205	TGGGC	2	10	57332	57341	0 %	20 %	60 %	20 %	258510064
1034	NC_013205	TCGCCA	2	12	57343	57354	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258510064
1035	NC_013205	TCG	2	6	57523	57528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510065
1036	NC_013205	TCC	2	6	57535	57540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510065
1037	NC_013205	TTC	2	6	57541	57546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510065
1038	NC_013205	GGA	2	6	57699	57704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510065
1039	NC_013205	GC	3	6	57832	57837	0 %	0 %	50 %	50 %	258510066
1040	NC_013205	TGGC	2	8	57849	57856	0 %	25 %	50 %	25 %	258510066
1041	NC_013205	CTGC	2	8	57861	57868	0 %	25 %	25 %	50 %	258510066
1042	NC_013205	GTG	2	6	57870	57875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510066
1043	NC_013205	CGG	2	6	57877	57882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510066
1044	NC_013205	TGG	2	6	57973	57978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510066
1045	NC_013205	TGT	2	6	57991	57996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510066
1046	NC_013205	CGA	2	6	58028	58033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510066
1047	NC_013205	CGC	2	6	58060	58065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510066
1048	NC_013205	CGG	2	6	58139	58144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510066
1049	NC_013205	CGT	2	6	58180	58185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510066
1050	NC_013205	CGG	2	6	58189	58194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510066
1051	NC_013205	TCGTG	2	10	58204	58213	0 %	40 %	40 %	20 %	258510066
1052	NC_013205	TTC	3	9	58221	58229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510066
1053	NC_013205	GCCGC	2	10	58255	58264	0 %	0 %	40 %	60 %	258510066
1054	NC_013205	TCA	2	6	58288	58293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510066
1055	NC_013205	ATG	2	6	58311	58316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510066
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1057	NC_013205	CGC	2	6	58540	58545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510067
1058	NC_013205	CGGTCT	2	12	58654	58665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510067
1059	NC_013205	GTG	2	6	58680	58685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510067
1060	NC_013205	GTCG	2	8	58760	58767	0 %	25 %	50 %	25 %	258510067
1061	NC_013205	GTG	2	6	58878	58883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510067
1062	NC_013205	TGA	2	6	58894	58899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510067
1063	NC_013205	CGT	2	6	58967	58972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510067
1064	NC_013205	CGT	2	6	58978	58983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510067
1065	NC_013205	GGC	2	6	59039	59044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510067
1066	NC_013205	CTGGC	2	10	59078	59087	0 %	20 %	40 %	40 %	258510067
1067	NC_013205	CGA	2	6	59119	59124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510067
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1072	NC_013205	GCG	2	6	59275	59280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510067
1073	NC_013205	CGC	2	6	59311	59316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510067
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1082	NC_013205	CCA	2	6	59750	59755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510067
1083	NC_013205	CGCC	2	8	59770	59777	0 %	0 %	25 %	75 %	258510067
1084	NC_013205	TCG	2	6	59827	59832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510067
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1087	NC_013205	CCA	2	6	59938	59943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510067
1088	NC_013205	GAG	2	6	59969	59974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510067
1089	NC_013205	CGA	2	6	60022	60027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510067
1090	NC_013205	GTC	2	6	60071	60076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510067
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1092	NC_013205	GGTT	2	8	60231	60238	0 %	50 %	50 %	0 %	258510067
1093	NC_013205	GCCGTT	2	12	60266	60277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510067
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1095	NC_013205	GTGCCG	2	12	60381	60392	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258510067
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1098	NC_013205	GCC	2	6	60527	60532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510067
1099	NC_013205	GGCG	2	8	60652	60659	0 %	0 %	75 %	25 %	258510067
1100	NC_013205	TGG	2	6	60676	60681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510067
1101	NC_013205	GC	3	6	60694	60699	0 %	0 %	50 %	50 %	258510067
1102	NC_013205	GCG	2	6	60747	60752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510067
1103	NC_013205	CGGA	2	8	60802	60809	25 %	0 %	50 %	25 %	258510067
1104	NC_013205	TGG	2	6	60841	60846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510067
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1106	NC_013205	GC	3	6	60969	60974	0 %	0 %	50 %	50 %	258510067
1107	NC_013205	GCG	2	6	61020	61025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510067
1108	NC_013205	GC	3	6	61102	61107	0 %	0 %	50 %	50 %	258510067
1109	NC_013205	TCG	3	9	61108	61116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510067
1110	NC_013205	CTGC	2	8	61171	61178	0 %	25 %	25 %	50 %	258510067
1111	NC_013205	CGG	2	6	61192	61197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510067
1112	NC_013205	ACG	2	6	61260	61265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510067
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1114	NC_013205	CGGC	2	8	61281	61288	0 %	0 %	50 %	50 %	258510067
1115	NC_013205	GCG	2	6	61320	61325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510067
1116	NC_013205	GCA	2	6	61374	61379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510067
1117	NC_013205	CG	3	6	61592	61597	0 %	0 %	50 %	50 %	258510068
1118	NC_013205	GAG	2	6	61656	61661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510068
1119	NC_013205	CG	4	8	61685	61692	0 %	0 %	50 %	50 %	258510068
1120	NC_013205	GC	3	6	61730	61735	0 %	0 %	50 %	50 %	258510068
1121	NC_013205	TGC	2	6	61939	61944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510068
1122	NC_013205	CGG	2	6	62023	62028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510068
1123	NC_013205	CGT	2	6	62045	62050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510068
1124	NC_013205	GATC	2	8	62051	62058	25 %	25 %	25 %	25 %	258510068
1125	NC_013205	GCGG	2	8	62165	62172	0 %	0 %	75 %	25 %	258510068
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1132	NC_013205	GGC	2	6	62345	62350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510068
1133	NC_013205	CGA	2	6	62396	62401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510068
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1237	NC_013205	GTG	2	6	68221	68226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510072
1238	NC_013205	TCG	2	6	68273	68278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510072
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1240	NC_013205	TGTT	2	8	68297	68304	0 %	75 %	25 %	0 %	258510072
1241	NC_013205	G	7	7	68306	68312	0 %	0 %	100 %	0 %	258510072
1242	NC_013205	AGGCGC	2	12	68377	68388	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258510073
1243	NC_013205	GGCA	2	8	68389	68396	25 %	0 %	50 %	25 %	258510073
1244	NC_013205	GCGGA	2	10	68466	68475	20 %	0 %	60 %	20 %	258510073
1245	NC_013205	AGG	2	6	68491	68496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510073
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1247	NC_013205	GGA	2	6	68561	68566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510073
1248	NC_013205	TC	3	6	68576	68581	0 %	50 %	0 %	50 %	258510073
1249	NC_013205	GAC	2	6	68592	68597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510073
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